扬州市人民政府印发《扬州市国民经济和社会发展第十五个五年规划纲要》。其中，“探索校地共建扬州医学院”被写入“校地合作重点事项清单”专栏。
扬州医学院起源于1950年6月苏北行政公署在高邮创办的“苏北卫生行政干部学校”（简称“苏北卫生学校”）。
1952年8月，苏北卫生局报请华东军政委员会卫生部和上海市卫生局同意，上海私立惠生高级助产职业学校迁并来扬州，校址在北河下（今扬州市妇幼保健医院附近），校名为苏北扬州助产学校。
1953年5月“苏北助产学校”更名为“江苏省扬州助产学校”，隶属于江苏省卫生厅。7月下旬，更名为“江苏省扬州医士学校”，并决定招收医士专业学生100名。
1956年6月，扬州医士学校更名为江苏省扬州医士助产士学校。1958年1月，学校增设了护士专业，学校改名为“江苏省扬州卫生学校”。
1958年6月7日，扬州卫生学校升格为扬州医学专科学校。
1962年6月17日，扬州医学专科学校停办，学校恢复为中专“扬州卫生学校”。1976年12月，扬州卫生学校扩建为江苏省新医学院扬州分院。
1979年1月，经国务院批准，恢复扬州医学专科学校，原“江苏新医学院扬州分院”正式改名为扬州医学专科学校。
1984年7月16日，教育部批准扬州医学专科学校升格为医学院，并定名为“扬州医学院”。
1992年5月，扬州医学院与扬州师范学院、江苏农学院、扬州工学院、扬州水利工程专科学校、江苏商业专业学校，联合组建扬州大学。合并后，扬州医学院从此降格为扬州大学的一个二级学院——“扬州大学医学院”。那个独立品牌的“扬州医学院”，就此消失在历史的长河中。
学校拥有1所直属附属医院（扬州市第一人民医院）和13所附属医院（江苏省苏北人民医院、扬州市妇幼保健院等），其中三级甲等综合医院或专科医院10所，以及扬州大学附属扬州疾病预防控制中心、遍布省内外的40余所教学实习医院、5家药学教学基地。